Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms