Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim12cD3Z3L3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms