Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms