Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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