Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms