Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms