Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms