Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp42B2RQC2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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