Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NhsB1AV60 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NhsB1AV60 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms