Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scn1aA2APX8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scn1aA2APX8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1aA2APX8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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