Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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