Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn34dA2AGU5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms