Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PtprfA2A8L5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprfA2A8L5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms