Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms