Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

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Length 1,129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atp11cQ9QZW0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms