Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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