Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phtf1Q9QZ09 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms