Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms