Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rabgef1Q9JM13 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rabgef1Q9JM13 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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