Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms