Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Erp27Q9D8U3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms