Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rep15Q9D7T1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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