Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms