Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms