Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CenpnQ9CZW2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms