Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms