Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms