Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms