Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms