Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms