Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms