Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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