Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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