Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms