Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RtcbQ99LF4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms