Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd1bQ99JY6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd1bQ99JY6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms