Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pacsin3Q99JB8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms