Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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