Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dkk4Q8VEJ3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms