Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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