Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdc34Q8CFI2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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