Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf17Q8CFA7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf17Q8CFA7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms