Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nup88Q8CEC0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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