Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nek11Q8C0Q4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nek11Q8C0Q4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nek11Q8C0Q4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nek11Q8C0Q4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nek11Q8C0Q4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nek11Q8C0Q4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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