Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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FarsaQ8C0C7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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