Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c2Q8BL74 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms