Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms