Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms