Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp11bQ6DFW5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11bQ6DFW5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms