Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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